得到相关情报的林上校判断：敌人应该是因为巨大的伤亡而胆寒了，因此改变了原来的计划，转而使用围困战术。
另外，由于敌人占据着机库、训练操场以及军人俱乐部，因此可以依托这些建筑物如同钉子一样钉在基地中间，使基地内部无法顺畅地交流沟通。
如果能够占据绝对优势，那么城市战中清剿残敌很简单。工兵们按部就班地用炸药炸毁墙壁、天花板、顶盖，偶尔动用一下火焰喷射器甚至云爆弹，便可以将城市中某个区域内的敌人全部清理干净。
然而，基地方面只能说是勉强打退了敌人的凶猛进攻，距离占据绝对优势还远着呢。
正如敌人夺取基地任何一个建筑物都需要付出极大的代价一样，基地方面想要收复失地，同样无法避免巨大的损失。
如此一来，基地方面就力有未逮了。因为基地方面在撤离了妇女以及伤员之后，剩下的有生力量加起来也才勉强超过一千。
这么点人手，守卫剩余的建筑物都显得力量薄弱，哪有多余的力量用来挥霍在收复失地上呢？
于是，基地里出现了相持不下的僵局。
停战结束后不久，基地里倒是重新响起了枪炮声，而且也一直没有彻底停歇。但枪声都很零落，偶尔响起连射的枪声和手榴弹、枪榴弹的爆炸声，但也很快就会停止。
因为基地方面珍惜战力，而十字军圣战组织虽然损失了大半的炮灰，但毕竟还剩下不少，所以主动发动骚扰战的还是入侵者。
通过俘虏口供得知，敌人占据了我军部分建筑后，也因此获得了一些粮食和武器。在停战期间，大多数在役官兵和十字军圣战组织成员撤出了基地，并且将缴获的粮食也大部分带出了基地，只留下很少的成员负责控制难民炮灰。
十字军圣战组织通过控制粮食，迫使难民们用抽签等方式抽出死士，不停地向基地官兵发动骚扰战。
敌人发动的骚扰战，每次都只是派出一两个人，顶多三四个人。这些死士多半是在天黑后以匍匐潜行的方式，慢慢靠近我军防守的建筑，然后往建筑内扔几颗手榴弹就算完成了任务。
完成任务后，这些死士便可以打卡下班回去吃饭——假如他们能够活着回去。
相对于一开始那种狂暴的进攻方式，骚扰战更像是不停在耳边嗡嗡嗡的苍蝇那样让人讨厌。但，基地官兵表示可以接受。
对付这种骚扰，只需要合理分配战士的体力即可。一部分轮值人员提高警惕，充当观察哨防备被偷袭，另一部分人则可以获得充分的休息。
因为防守的士兵一直提高警惕，所以“死士”们执行骚扰任务极少能够成功，能活着回去的更是凤毛麟角。
虽然被抽中执行任务便意味着九死一生，但被抽中的难民们仍旧前赴后继。因为，死亡对那些难民来说不再让他们恐惧，反而是一种解脱。在难民的心目中，饥饿是比死亡更可怕的事情。
掌握了食物分配权的十字军圣战组织，只需要用断绝食物这一简单的招数，便能够驱使难民们不停地骚扰基地官兵。
一开始，基地方面不明白敌人为什么会采取骚扰战。慢慢的，基地方面终于明白了十字军圣战组织的阴谋。
大灾之后必有大疫。之前激战过后，基地里遗留了太多的尸体。如此多的尸体没得到及时的处理，腐败变质后，各种病菌通过空气传播感染附近的生物，致使基地官兵开始大规模染病。
而这时，由于十字军圣战组织的主力都撤离了疫区，因此在疫情爆发后几乎没什么损失。